内蒙古农业大学关于“混合深度宏基因组测序揭示肠道微生物低丰度物种特征”研究成果在《GutMicrob

近日，由内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室完成的深度混合宏基因组测序挖掘肠道微生物低丰度物种研究成果发表于肠道微生物领域权威杂志《GutMicrobes》（中科院一区，肠道微生物领域Top期刊），题目为Hybrid,ultra-deepmetagenomicsequencingenablesgenomicandfunctionalcharacterizationoflow-abundancespeciesinthehumangutmicrobiome（DOI:10.1080/19490976.2021.2021790）。该研究采用Illumina与Pacbio混合、超深度宏基因组测序的方法，首次聚焦于发掘肠道中的低丰度物种基因组的功能特征，组装得到475个宏基因组组装基因组（MAG），包括287个低丰度和77个极低丰度基因组。同时，该研究发现微生物基因组生长速率、选择压力及染色体可移动遗传元件频率存在个体异质性，鉴定出数千个染色体外的可移动遗传元件，包括5097个噬菌体和79个新的质粒基因组，为理解肠道生态学和肠道菌群的功能特征提供了新见解。该项目由国家自然科学基金国际合作重点项目（31720103911）、国家现代农业产业技术体系和内蒙古科技重大专项（2021ZD0014）资助。